O Museu Nacional de História Natural e da Ciência -- MUHNAC, com h mudo -- faz parte de uma Unidade Especializada dos Serviços Centrais da Universidade de Lisboa designada «Museus da Universidade de Lisboa/Instituto de Investigação Científica Tropical». Essa unidade tem responsabilidade de gestão, preservação e acesso público sobre três importantes polos patrimoniais de natureza científica em Lisboa:
- o pólo-sede, no Príncipe Real: MUHNAC e Jardim Botânico de Lisboa
- o pólo de Belém: Jardim Botânico Tropical
- o pólo da Ajuda: Observatório Astronómico de Lisboa
A missão do MUHNAC consiste em promover a curiosidade e a compreensão pública sobre a natureza e a ciência, aproximando a Universidade à Sociedade. Essa missão é atingida através da valorização das suas coleções e do património universitário, da investigação, da realização de exposições, conferências e outras iniciativas de carácter científico, educativo, cultural e de lazer.
O Museu faz parte da Rede Portuguesa de Museus desde 2002. É membro institucional da Associação Portuguesa de Jardins Históricos, da Botanic Gardens Conservation International (BGCI) e da Universeum -- European University Heritage Network.